科学家本（Zach Galifianakis 饰）隶属于美国政府某个秘密部门它通过高科技手段训练豚鼠说话与思考并将它们培养成特工人员然而本的部门却面临被FBI关闭的局面为了证明他和豚鼠特工的能力本向豚鼠特工队的负责鼠达尔文（山姆·洛克威尔 Sam Rockwell 配音）下令要它们潜入赛博林工业的CEO罗纳德·赛博（Bill Nighy 饰）的办公室寻找罗纳德向中东国家出卖可用于军事的高科技芯片的证据达尔文毫不怠慢带着布拉斯特（崔西·摩根 Tracy Morgan 配音）、华蕾斯（佩内洛普·克鲁兹 Penélope Cruz 配音）、苍蝇莫奇和斯贝克斯（尼古拉斯·凯奇 Nicolas Cage 配音）等成员迅速展开行动 　　这群豚鼠特工队员体型虽小却身怀绝技它们成功闯入罗纳德的办公室并下载到重要资料然而这场冒险才刚刚开始…...